Ibaon ang mga nalalabi na natatakot sa tubig at panoorin ang pagbaba ng enerhiya.
Bibigyan ka ng isang chain ng residues, ilang hydrophobic (H) at ilang hindi. I-fold ito sa grid upang ang mga hydrophobic residues ay mag-cluster sa isang nakabaon na core — bawat hindi katabing H-H pares na magtatapos sa paghawak ay nagpapababa ng enerhiya ng istraktura. Abutin ang pinakamababang enerhiya upang malutas ito.
Ang Protein Fold ay isang biochemistry puzzle na binuo sa kung paano nakatiklop ang mga protina sa paligid ng isang hydrophobic core, ang prinsipyong nagbibigay sa mga protina ng kanilang hugis.
Ang pagtitiklop ng kadena ng mga hydrophobic at polar na residue upang maibaon ang mga hydrophobic sa isang core, na minamarkahan ang bawat hindi magkatabing H-H contact, ay ang HP lattice model ng protein folding.
Ang tuwirang pagmamarka sa mga nakabaong contact ang orihinal na pagpapasimple.
Matinding pagpapasimple ito na pinananatili ang mahalagang pisika. Ang hydrophobic effect — ang pagsasama-sama ng mga nonpolar na grupo dahil pinalalaki nito ang entropy ng nakapaligid na tubig — ang nangingibabaw na puwersang nagtutulak sa isang protina sa hugis nito, kaya ang modelong halos wala nang iba ay nakalilikha pa rin ng mga tiklop na makikilalang parang protina.
Ang Protein Fold ay isang biochemistry puzzle na binuo sa paligid ng hydrophobic-core na mga modelo ng natitiklop na protina. Ito ay isang orihinal at libreng laro ng browser na ginawa sa bahay para sa PlayPendium.